但是即使沒有這些資質,測序服務機構也能以科研報告的形式提供檢測服務(規避醫學檢驗的限制),或者與試點醫院成立聯合實驗室,享受利潤分成。
這些都折射出當前我國基因行業監管的不成熟,美國臨檢機構采取的是CLIA/CAP認證的形式,很大可能我國未來也會采取類似的認證資質。
應用領域的監管:目前高通量測序臨床上的應用還只能試點應用于遺傳病診斷、產前篩查與診斷、植入前胚胎遺傳學診斷和腫瘤診斷與治療四個專業方向。
但是在心血管領域、感染性疾病、腸道微生物宏基因組學等領域,二代測序都有良好的應用前景,當前的臨床高通量測序試點只是LDT試點在某個專業方向的具體應用,未來應用領域會越來越廣。
儀器試劑的監管:由CFDA進行審批,高通量測序中需要申報的有測序儀(綁定上機試劑)、建庫試劑盒、檢測試劑盒、分析軟件等。
NIPT方面,CFDA先后批準了華大基因(BGISEQ-100基于life的Ion Torrent技術、BGISEQ-1000基于華大基因之前收購的Complete Genomics的測序技術)、達安基因(DA Proton基于life的Ion Torrent技術)、博奧生物(BioelectronSeq 4000基于life的Ion Torrent技術)、貝瑞和康(與Illumina合作的NextSeq CN500)的NIPT二代基因測序儀和配套試劑(13、18、21號染色體三體檢測試劑盒、上機測序試劑);
在腫瘤方面,目前目前還沒有高通量測序儀和高通量檢測試劑盒獲批,試點單位只能以自制試劑(LDTs)的形式開展檢測服務。
從長遠來看,多目標基因panel(幾十上百個基因或靶點)高通量檢測試劑盒基本沒有獲批的可能,因為位點突變率很低,很難找到足夠的病人開展臨床試驗,并且檢測結果也無法去驗證,所以這類試劑盒只能以LTDs的形式在臨檢實驗室使用,無法外售;
而少量目標基因(數個基因,少量突變位點)的檢測試劑盒可能會被CFDA審批,但是從檢測成本來說,少量目標基因的檢測成本不會比多目標基因檢測低,所以終端價格相差不大,當與多目標基因panel一起進行市場推廣的時候,并不具有優勢。
總結:當前國內高通量測序在臨床上的應用監管還很不成熟,試點名單是名義上具有出具臨床檢驗報告資質的機構,并不是其他機構開展測序服務的限制條件(能以科研的形式開展服務),儀器、試劑的審批也不具備限制性,市場處于洗牌階段,基因檢測公司需要積極進行兩手準備,一方面籌備臨檢資質的申報,積極布局醫院終端,一方面著手儀器、試劑的審批。我國未來可能采取和美國類似的CLIA/CAP審批,優先布局醫院渠道的有望受益。
案例(美國CLIA認證):
在美國,只要通過了CLIA(Clinical Laboratory Improvement Amendments,臨床實驗室改進法案)認證,第三方實驗室就可以根據市場需求,開發出各種新的診斷試劑或服務,即自建項目或者自制試劑(LDTs)。
這種檢測只能在該實驗室內使用,不能外傳或者出售給其他任何實驗室或者醫療保健機構,從而將風險控制在有限的范圍,因而不需要FDA的批準。同時,由于CLIA認證的是實驗室,所以并不需要對每個新服務或產品作出審批申請。醫院或者病人可以根據自己的需要,選擇相應的診斷項目。這個政策給了第三方實驗室極大的自由空間,也帶來了美國獨立實驗室的繁榮發展。
CLIA 認證最獨特的地方在于,實驗室自建項目即使在沒有FDA批準的情況下,也完全可以在其實驗室范圍內提供分子檢測業務來指導臨床。只要是有CLIA執照的實驗室,他們自己研發的制劑、技術等也可以合法地進入臨床,合理收費。
這樣做的好處就是:在巨大的醫療需求、和日新月異的新技術面前,所有的CLIA實驗室可以跟據市場需求,快速地開發出各種新的診斷應用。同時,美國政府不必對應接不暇的每個新應用做出回應。而病人可以根據自己的需要,即時得到新的診斷服務。同時FDA可以選擇FDA認為真正好的診斷方法做進一步認證,并以FDA的名義發布認證,以加速FDA認為好的診斷方法在市場上的應用。申報企業只要通過了CLIA認證,并能保證產品的質量,那么就可以直接應用于臨床上。
二、基因測序的行業焦點:重在服務
基因測序重在服務,很難單獨依靠商品(檢測試劑盒、芯片)來建立優勢,這與免疫診斷、化學發光有所不同,因為基因檢測歸根結底都是DNA一級序列的檢測,與二級、三級結構無關,檢測原理相對簡單,都是通過DNA引物靶定待測序列,然后通過引物延伸來實現序列的測定;相反,樣品DNA的提取、建庫和捕獲的操作倒是比較繁瑣,需要專業的技術人員去操作。
上游儀器已然被少數幾個公司所壟斷,中上游的試劑盒產品并不具有很高的技術壁壘(當然如果能在建庫環節和捕獲環節形成明顯技術優勢,或者是開發出效率更高的工具酶,也是很有發展前景的),而且高通量基因檢測試劑盒的審批存在較大的不確定性(未來可能參照美國CLIA認證的方式,具有資質的檢測機構以LTDs自制試劑的形式使用,但是不通過藥監局的審批就無法對外銷售),醫院樣本量有限,先進入的肯定會占據諸多優勢,NIPT市場已經接近飽和,腫瘤醫院的爭奪也日趨白熱化,所以率先通過服務來搶占市場,這或許是較為穩妥的選擇。
醫院是否會自行購置測序儀開展高通量測序?如果醫院自己測序,那么臨檢測序機構勢必難以競爭,所以思考這個因素是有必要的。這個問題要分開來看,一方面考慮用戶的數量和需求,一方面考慮測序成本。以當前高通量測序用的最廣泛的是NIPT和腫瘤診治為例進行分析:
在無創產前診斷領域,我國每年的新生兒在1500萬人左右,潛在客戶基數大,NIPT能夠給出明確的診斷結果和對應的防治措施,而且結果關系到下一代的健康,檢測價格在2400元左右,受眾廣泛;
此外,NIPT對測序的精度要求不是特別高(目前主要是針對13、18、21號染色體的三體檢查),檢測是一個定量的過程,通常采用life ion torrent平臺(目前獲批的5款儀器里面3家申報的是ion torrent,而且美國已經有機構采用基因芯片來做NIPT),很多大型醫院能夠自行開展NIPT服務,第三方測序機構的目標市場應該在中小型醫院。
但是高通量測序在腫瘤領域的應用就不太一樣,我國每年新增腫瘤患者在450萬人左右,腫瘤panel測序的價格在8千到2萬之間,而且現在做腫瘤panel測序的患者主要目的是獲得靶向藥物用藥指導,靶向藥物價格比較昂貴(每個月的用藥開銷在5萬左右),所以目標人群就更加狹窄了;
此外,腫瘤檢測對測序精度要求比較高,主要針對點突變或者微缺失微重復,對技術平臺的要求高,通常采用Illumina Hiseq/next Seq測序儀,儀器設備昂貴,并且開機試劑耗材的花費高(一次開機在15萬左右),如果沒有足夠的樣本量,基本上每次開機都是虧損;
并且腫瘤數據的分析比較復雜,需要專門的生物信息學人才和數據庫,所以在腫瘤領域(在其他病患更少的領域更是如此),我們認為高通量測序還是以第三方臨檢機構為主,目標市場在大型醫院。